up_icon
Health Science

Nvidia και Stanford μειώνουν την ταχύτητα αλληλούχισης DNA στις 5 ώρες

01 Μαρτίου 2022 Sofia Ntounia

Nvidia και Stanford μειώνουν την ταχύτητα αλληλούχισης DNA στις 5 ώρες

Μία ερευνητική ομάδα συμπεριλαμβανομένων και επιστημόνων του Πανεπιστημίου του Stanford κατάφερε να επιταχύνει κατά πολύ τη διαδικασία προσδιορισμού της αλληλουχίας του DNA, καταρρίπτοντας το προϋπάρχον παγκόσμιο ρεκόρ Guinness. Η έρευνα έγινε με επικεφαλή τον Δρ. Euan Ashley, καθηγητή ιατρικής, γενετικής και βιοϊατρικών δεδομένων στη Σχολή Ιατρικής του Πανεπιστημίου του Stanford, σε συνεργασία με τις εταιρείες Nvidia, Oxford Nanopore Technologies, Google και με τα ιατρικά εκπαιδευτικά ιδρύματα Baylor College στο Τέξας και του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνια. Οι επιστήμονες κατάφεραν κατά πολύ να αυξήσουν τη ταχύτητα των σχετικών εργασιών τους ώστε η όλη διαδικασία να πάρει κάτι λιγότερο από πέντε ώρες και δύο λεπτά. Το προηγούμενο ρεκόρ για την αλληλούχιση DNA κατείχε το Παιδικό Ινστιτούτο Rady με υπερδιπλάσιο χρόνο, σχεδόν 14 ώρες.

Οι ερευνητές κατάφεραν να επιταχύνουν κάθε στάδιο της διαδικασίας για την αλληλούχιση του γονιδιώματος, βασιζόμενοι στη νέα τεχνολογία. Αυτή περιλάμβανε τη χρήση των κυψελών PromethION της Oxford Nanopore, κάρτες γραφικών της Nvidia και την εφαρμογή υπολογιστικής γονιδιωματικής Clara Parabricks, καθώς και το Google Cloud, ώστε να είναι δυνατή η συλλογή και επεξεργασία τεράστιου όγκου δεδομένων, 100 εκατομμυρίων βάσεων (νουκλεοτιδίων) την ώρα, επίσης η αναγνώριση των βάσεων και των παραλλαγών γονιδίων. Οι αγωγοί δεδομένων και συστήματα αποθήκευσης επίσης επανεξετάστηκαν κι επανασχεδιάστηκαν.

Η συγκεκριμένη ομάδα επιστημόνων προσπαθεί να μειώσει ακόμα περισσότερο τον χρόνο που θα χρειάζεται για τη διαδικασία αλληλούχισης DNA, ίσως στο μισό και πάλι, κάτι που θα έχει δραματικά θετικές επιπτώσεις, αφού οι γιατροί θα δύναται να διαγνώσουν ασθενείς και να παρέχουν προσαρμοσμένες θεραπείες ακόμα γρηγορότερα, κάτι που είναι ιδιαίτερης σημασίας και βαρύτητας ιδίως για τους ασθενείς της μονάδας εντατικής θεραπείας των νοσοκομείων.

Η συγκεκριμένη μελέτη δημοσιεύτηκε πρόσφατα στο κορυφαίο επιστημονικό περιοδικό The New England Journal of Medicine.

Sofia Ntounia

ΣΧΟΛΙΑ
read more

Meteor Blaster: Το παιχνίδι που εντοπίζει ενδείξεις γλαυκώματος σε πρώιμο στάδιο

05 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Στις πρώτες δεκαετίες του gaming (ειδικά στα ‘80s και τα ‘90s) κυριαρχούσε η αντίληψη ότι οι πολλές ώρες μπροστά στην οθόνη θα μπορούσαν να προκαλέσουν προβλήματα στα μάτια των gamers (και γενικότερα των ...

Google: Θα αφαιρεί το ιστορικό τοποθεσίας για επισκέψεις σε κλινικές αμβλώσεων

02 Ιουλίου 2022 Christos Elpidis

Την περασμένη εβδομάδα είδαμε τη Meta να παίρνει την απόφαση να αφαιρέσει όλες τις αναρτήσεις και διαφημίσεις που αφορούν χάπια αποβολής από τις πλατφόρμες της (Facebook, Instagram). Η επίσημη αιτιολογία είναι ...

Facebook και Instagram αφαιρούν άμεσα περιεχόμενο που σχετίζεται με χάπια αποβολής

28 Ιουνίου 2022 Christos Elpidis

Στον απόηχο της απόφασης του Ανώτατου Δικαστηρίου των ΗΠΑ να ανατρέψει το συνταγματικό δικαίωμα των γυναικών στην έκτρωση, η οποία έχει φέρει αναμενόμενα σωρεία αντιδράσεων σε όλο τον κόσμο, τα Facebook και ...

Αναπτύχθηκαν οι πρώτοι φακοί επαφής που ταυτόχρονα θεραπεύουν παθήσεις των ματιών

14 Απριλίου 2022 Sofia Ntounia

Οι μισοί περίπου χρήστες φακών επαφής υποφέρουν με την έναρξη των εποχικών αλλεργιών, λόγω φαγούρας στα μάτια. Η εταιρεία Johnson & Johnson έχει πλέον αναπτύξει έναν νέο τρόπο αντιμετώπισης της αλλεργίας, ...

Πλαστικά σωματίδια βρέθηκαν για πρώτη φορά βαθιά στους πνεύμονες ζωντανών ανθρώπων

12 Απριλίου 2022 Sofia Ntounia

Τα τελευταία χρόνια, όλο και περισσότερες μελέτες έρχονται να αποδείξουν τη ρύπανση του περιβάλλοντος από πλαστικό ακόμα και στα πιο απόμακρα μέρη, όπως είναι η Αρκτική, η Ανταρκτική, ακόμα το ψηλότερο βουνό ...

Καταπολέμηση της παχυσαρκίας με έγχυση υδρογέλης στις αποθήκες λίπους

29 Μαρτίου 2022 Sofia Ntounia

Επιστήμονες στο Τεχνολογικό Πανεπιστήμιο Nanyang της Σιγκαπούρης σχεδίασαν μία νέα και πολλά υποσχόμενη θεραπεία για την καταπολέμηση της παχυσαρκίας. Αναπτύσσοντας μια ενέσιμη υδρογέλη και συνδυάζοντας το ...

Πλαστικά σωματίδια ανιχνεύονται για πρώτη φορά στο ανθρώπινο αίμα

28 Μαρτίου 2022 Sofia Ntounia

Επιστήμονες από το Πανεπιστήμιο Vrije στην Ολλανδία έριξαν πρόσφατα φως στην έκταση που έχει πάρει το πρόβλημα της ρύπανσης από πλαστικό, εντοπίζοντας μικροπλαστικά σωματίδια στην κυκλοφορία του αίματος και ...

Έτοιμο για κλινικές δοκιμές σε ανθρώπους το πρώτο ανδρικό αντισυλληπτικό χάπι

24 Μαρτίου 2022 Sofia Ntounia

Επιστήμονες στο Πανεπιστήμιο της Μινεσότα κατάφεραν να δημιουργήσουν το πρώτο αντισυλληπτικό χάπι που απευθύνεται σε άνδρες. Πέρα από τη χρήση του προφυλακτικού αλλά και μια πιθανή χειρουργική επέμβαση, ...

2 δισ. γενετικά τροποποιημένα κουνούπια θα απελευθερωθούν στη Florida

22 Μαρτίου 2022 Sofia Ntounia

Η Υπηρεσία Προστασίας του Περιβάλλοντος των ΗΠΑ (EPA) έχει εγκρίνει τη χρήση των γενετικά τροποποιημένων κουνουπιών της εταιρείας Oxitec, ως μέρος μιας στρατηγικής για τον έλεγχο μετάδοσης των ασθενειών που ...

Νεές και πολύ ενδιαφέρουσες εξελίξεις σχετικά με την αντιγήρανση

16 Μαρτίου 2022 Sofia Ntounia

Παράγοντες που επιβραδύνουν τη διαδικασία της γήρανσης πετυχαίνουν με ασφάλεια να επαναφέρουν ώριμα κύτταρα στην κατάσταση νεοτέρων κυττάρων στα ποντίκια και βοηθούν στην αποκατάσταση της υγείας τους. Οι ...

Loader
techgear_icon