up_icon
Technology Nvidia Science

AtacWorks: Το νέο εργαλείο των Nvidia και Harvard για δραματικά ταχύτερη ανάλυση γονιδιώματος

09 Μαρτίου 2021 Christos Elpidis

AtacWorks: Το νέο εργαλείο των Nvidia και Harvard για δραματικά ταχύτερη ανάλυση γονιδιώματος

Η συνεργασία μεταξύ των ερευνητών της Nvidia και του Harvard αποδίδει καρπούς, καθώς ανακοίνωσαν μια πολύ σημαντική εξέλιξη που αφορά την Γενετική. Συγκεκριμένα, ανέπτυξαν ένα νέο σύστημα μηχανικής μάθησης που μειώνει δραματικά τον χρόνο και το κόστος που απαιτείται για την ανάλυση του γονιδιώματος, με την υποστήριξη των Tensor Core GPUs της Nvidia.

Το εργαλείο ονομάζεται AtacWorks και χρησιμοποιεί τη μέθοδο ATAC-seq για να εντοπίζει τις λειτουργικές περιοχές στο DNA υγιών και ασθενών κυττάρων, οι οποίες καθορίζουν και ενεργοποιούν συγκεκριμένες διεργασίες. Σύμφωνα με τους ερευνητές, η πλήρης ανάλυση του γονιδιώματος εκτελείται πλέον μέσα σε μόλις 30 λεπτά, ενώ το συνηθισμένο μέχρι σήμερα είναι οι 48 ώρες. Χάριν στην ταχύτερη ανάλυση, οι ερευνητές θα μπορούν να εντοπίζουν πολύ πιο γρήγορα ενδείξεις στο γονιδίωμα του ανθρώπου για διάφορες ασθένειες (π.χ. Alzheimer, καρκίνους κλπ.).

Η μέθοδος ATAC-seq απαιτεί συνήθως την ανάλυση δεκάδων χιλιάδων κυττάρων, παρόλα αυτά, με το AtacWorks καταφέρνουν να λαμβάνουν τα ίδια αποτελέσματα με μόλις μερικές δεκάδες κυττάρων. Η δυνατότητα ανάλυσης του γονιδιώματος ταχύτερα και φθηνότερα θα ανοίξει νέους δρόμους για την έγκαιρη παρατήρηση βιοδεικτών που ενδεχομένως να υποδηλώνουν την μελλοντική εκδήλωση συγκεκριμένων ασθενειών. Επομένως, οι ερευνητές θα έχουν τις απαραίτητες πληροφορίες τόσο για την πρόληψη, όσο και για την παρατήρηση του τρόπου εξέλιξης της ασθένειας, προκειμένου να αναπτύξουν πιο στοχευμένες θεραπείες και φάρμακα.

Όπως αναφέρει η επικεφαλής της έρευνας από τη Nvidia, κ. Avantika Lal,

Ειδικά στην περίπτωση των πολύ σπάνιων κυττάρων, δεν είναι εφικτό να μελετηθούν οι διαφοροποιήσεις στο DNA τους με τις υπάρχουσες μεθόδους. Το AtacWorks μπορεί να βοηθήσει όχι μόνο στη μείωση του κόστους για τη συλλογή δεδομένων, αλλά θα ανοίξει νέες δυνατότητες για τη διάγνωση και την ανάπτυξη φαρμάκων.

Ένα παράδειγμα χρήσης του AtacWorks που αποδεικνύει τη χρησιμότητα του είναι αυτό της ανάλυσης βλαστοκυττάρων που παράγουν ερυθρά και λευκά αιμοσφαίρια. Με τις παραδοσιακές μεθόδους θεωρείται αδύνατη η μελέτη τους, παρόλα αυτά, με το AtacWorks κατάφεραν να εντοπίσουν ξεχωριστές αλληλουχίες στο DNA των βλαστοκυττάρων που σχετίζονται με τα λευκά και τα ερυθρά αιμοσφαίρια αντίστοιχα.

*Ακολουθήστε το Techgear.gr στο Google News για να ενημερώνεστε άμεσα για όλα τα νέα άρθρα! Όσοι χρησιμοποιείτε υπηρεσία RSS (π.χ. Feedly), μπορείτε να προσθέσετε το techgear.gr στη λίστα σας με αντιγραφή και επικόλληση της διεύθυνσης https://www.techgear.gr/feed στο αντίστοιχο πεδίο της υπηρεσίας σας. Αν προτιμάτε το Twitter, θα μας βρείτε στο προφίλ @techgeargr.

[Nvidia]

Christos Elpidis

Το ταξίδι ξεκίνησε από έναν Atari ST 520 στα '80s για μια μακρά περίοδο καψίματος στο gaming με το Kick Off 2 (αν είχε eSports τότε θα ήμουν εκατομμυριούχος...) και τα κλασικά adventures. Μετά ήρθαν τα PCs, το Internet, τα MP3s, τα Mac, τα κινητά, τα smartphones και όλα τα μαραφέτια που ορίζουν την καθημερινότητα μας σήμερα.

Για όλα αυτά τα λέμε τα τελευταία 10 χρόνια μέσα από το Techgear.gr! Θα με βρείτε σε Twitter, Instagram και φυσικά στη Darkpony Digital!

ΣΧΟΛΙΑ
read more

Bruce Willis: Ο πρώτος ηθοποιός που πούλησε τα δικαιώματα χρήσης της εικόνας του για deepfakes [Update]

30 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Η στροφή (και) της βιομηχανίας του κινηματογράφου στις νέες τεχνολογίες είναι εμφανής τα τελευταία χρόνια με πληθώρα παραδειγμάτων, όπως η απεικόνιση του Robert De Niro σε διάφορες ηλικίες στην ταινία The ...

James Earl Jones: Η φωνή του Darth Vader θα ζει...για πάντα μέσω AI

26 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Πέρασαν 45 χρόνια από τότε που ο James Earl Jones έδωσε για πρώτη φορά την χαρακτηριστική φωνή του στον Darth Vader, αλλά τώρα, σε ηλικία 91 ετών αντιλαμβάνεται πως ήρθε το πλήρωμα του χρόνου για να βρεθεί ο ...

Vodafone: Σε κίνδυνο ο στόχος της ΕΕ για «έξυπνες πόλεις» μέχρι το 2030

22 Σεπτεμβρίου 2022 Techgear Team

Νέα έκθεση της Vodafone για την ψηφιοποίηση των πόλεων σε πανευρωπαϊκό επίπεδο αποκαλύπτει ότι θα απαιτηθούν επείγοντα μέτρα προκειμένου να ξεπεραστούν τα υπάρχοντα εμπόδια και να στεφθεί με επιτυχία ο ...

LG Rollable: Το ακυρωμένο smartphone με την τυλισσόμενη οθόνη σε hands-on video

21 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Η LG πειραματιζόταν για αρκετό καιρό με τις εύκαμπτες οθόνες της προκειμένου να προσφέρει μια διαφορετική προσέγγιση στην κατηγορία των smartphones. Σε αντίθεση με όσα έχουμε δει μέχρι σήμερα, δηλαδή τα ...

YouTuber δοκιμάζει αν λειτουργεί το Crash Detection της Apple [Video]

21 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Στο πρόσφατο Apple Event για την παρουσίαση των νέων iPhone 14 και των Apple Watch Series 8, Apple Watch Ultra, η εταιρεία στάθηκε ιδιαίτερα στη λειτουργία Crash Detection των νέων συσκευών της για την αυτόματη...

ΗΠΑ: Χρηματόδοτηση ύψους $900 εκατ. για σταθμούς φόρτισης ηλεκτρικών οχημάτων

16 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Η κυβέρνηση των ΗΠΑ εντείνει ακόμη περισσότερο τις ενέργειες της για ένα μέλλον με ηλεκτρικά οχήματα, καθώς ο πρόεδρος Biden επιβεβαίωσε πως θα χρηματοδοτήσει με περισσότερα από $900 εκατομμύρια την τοποθέτηση ...

Wi-Fi 7: Νέα επίδειξη του προτύπου από Intel και Broadcom, έπιασαν ταχύτητα 5Gbps

13 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Η δουλειά επάνω στο πρότυπο Wi-Fi 7 έχει ξεκινήσει από τον περασμένο Ιανουάριο, όταν η MediaTek πραγματοποίησε την πρώτη επίδειξη, ενώ ακολούθησε η Qualcomm τον Μάιο με την παρουσίαση των πρώτων Wi-Fi 7 ...

Η κυβέρνηση Biden θέτει κανόνες για να «περιορίσει» την τεχνολογική ανάπτυξη της Κίνας

09 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Μόλις τον προηγούμενο μήνα η κυβέρνηση Biden ενέκρινε το πρόγραμμα CHIPS για την ενίσχυση της βιομηχανίας ημιαγωγών στις ΗΠΑ, με μια επένδυση που θα ξεπεράσει τα $280 δισεκατομμύρια για έρευνες και ανάπτυξη ...

Λύση στο ενεργειακό πρόβλημα με παραγωγή καύσιμου υδρογόνου από ελάχιστη υγρασία

07 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Δεν είναι η πρώτη φορά που διαβάζουμε για έρευνες σχετικά με την παραγωγή καύσιμου υδρογόνου για την λύση του ενεργειακού προβλήματος, αλλά το επίτευγμα των ερευνητών του University of Melbourne παρουσιάζει ...

USB4 Version 2.0: Το νέο πρότυπο για ταχύτητα μεταφοράς δεδομένων έως 80 Gbps

05 Σεπτεμβρίου 2022 Christos Elpidis

Σχεδόν 3μιση χρόνια πέρασαν από την πρώτη παρουσίαση του προτύπου USB 4.0 από την Intel και τώρα έφτασε η ώρα να ανακοινωθεί επίσημα από το USB Promoter Group (σε αυτό συμμετέχουν μεταξύ άλλων οι Microsoft, ...

Loader
techgear_icon